Παρακαλώ χρησιμοποιήστε αυτό το αναγνωριστικό για να παραπέμψετε ή να δημιουργήσετε σύνδεσμο προς αυτό το τεκμήριο:
https://hdl.handle.net/10442/7511
| Εξειδίκευση τύπου : | Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό |
| Τίτλος: | DNA denaturation bubbles at criticality |
| Δημιουργός/Συγγραφέας: | [EL] Θεοδωρακόπουλος, Νίκος[EN] Theodorakopoulos, Nikos |
| Εκδότης: | American Physical Society |
| Ημερομηνία: | 2008 |
| Γλώσσα: | Αγγλικά |
| DOI: | 10.1103/physreve.77.031919 |
| Περίληψη: | The equilibrium statistical properties of DNA denaturation bubbles are examined in detail within the framework of the Peyrard-Bishop-Dauxois model. Bubble formation in homogeneous DNA is found to depend crucially on the presence of nonlinear base-stacking interactions. Small bubbles extending over less than 10 base pairs are associated with much larger free energies of formation per site than larger bubbles. As the critical temperature is approached, the free energy associated with further bubble growth becomes vanishingly small. An analysis of average displacement profiles of bubbles of varying sizes at different temperatures reveals almost identical scaled shapes in the absence of nonlinear stacking; nonlinear stacking leads to distinct scaled shapes of large and small bubbles. |
| Τίτλος πηγής δημοσίευσης: | Physical Review E |
| Τόμος/Κεφάλαιο: | 77 |
| Σελίδες: | 031919-1-031919-8 |
| Θεματική Κατηγορία: | [EL] Φυσική και θεωρητική χημεία[EN] Physical and theoretical chemistry |
| Κάτοχος πνευματικών δικαιωμάτων: | © The Authors/Creators |
| Σημειώσεις: | This is also available in Arxiv at: http://arxiv.org/abs/0802.2194
The full text is available at: http://arxiv.org/PS_cache/arxiv/pdf/0802/0802.2194v1.pdf |
| Εμφανίζεται στις συλλογές: | Ινστιτούτο Θεωρητικής και Φυσικής Χημείας (ΙΘΦΧ) - Επιστημονικό έργο
|
