Εξειδίκευση τύπου :	Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό
Τίτλος:	Melting of genomic DNA: Predictive modeling by nonlinear lattice dynamics
Δημιουργός/Συγγραφέας:	[EL] Θεοδωρακόπουλος, Νίκος[EN] Theodorakopoulos, Nikos
Εκδότης:	American Physical Society
Τόπος έκδοσης:	College Pk
Ημερομηνία:	2010-08-06
Γλώσσα:	Αγγλικά
ISSN:	1539-3755
DOI:	10.1103/PhysRevE.82.021905
Περίληψη:	The melting behavior of long, heterogeneous DNA chains is examined within the framework of the nonlinear lattice dynamics based Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) model. Data for the pBR322 plasmid and the complete T7 phage have been used to obtain model fits and determine parameter dependence on salt content. Melting curves predicted for the complete fd phage and the Y1 and Y2 fragments of the phi X174 phage without any adjustable parameters are in good agreement with experiment. The calculated probabilities for single base-pair opening are consistent with values obtained from imino proton exchange experiments.
Τίτλος πηγής δημοσίευσης:	Physical Review E
Τόμος/Κεφάλαιο:	82
Τεύχος:	2
Σελίδες:	[4]
Θεματική Κατηγορία:	[EL] Φυσική[EN] Physics
Λέξεις-Κλειδιά:	Physics, Fluids & Plasmas Physics, Mathematical
Αξιολόγηση από ομότιμους (peer reviewed):	Ναι
Όροι και προϋποθέσεις δικαιωμάτων:	This article may be downloaded for personal use only. Any other use requires prior permission of the author and American Physical Society (APS). The article appears in "Phys. Rev. E, V82, Issue 2, p. 1905 – Published 6 August 2010" and can be found at the following URL on the APS website: https://journals.aps.org/pre/abstract/10.1103/PhysRevE.82.021905
Σημειώσεις:	Part 1
Εμφανίζεται στις συλλογές:	Ινστιτούτο Θεωρητικής και Φυσικής Χημείας (ΙΘΦΧ) - Επιστημονικό έργο