Εξειδίκευση τύπου :	Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό
Τίτλος:	GOrevenge: A Novel Generic Reverse Engineering Method for the Identification of Critical Molecular Players, Through the Use of Ontologies
Δημιουργός/Συγγραφέας:	Moutselos, Konstantinos Maglogiannis, Ilias [EL] Χατζηιωάννου, Αριστοτέλης[EN] Chatziioannou, Aristotelis
Εκδότης:	IEEE-inst Electrical Electronics Engineers Incorporated
Τόπος έκδοσης:	Piscataway
Ημερομηνία:	2011-12
Γλώσσα:	Αγγλικά
ISSN:	0018-9294
DOI:	10.1109/TBME.2011.2164794
Περίληψη:	The ever-increasing use of ontologies in modern biological analysis and interpretation facilitates the understanding of the cellular procedures, their hierarchical organization, and their potential interactions at a system's level. Currently, the gene ontology serves as a paradigm, where through the annotation of whole genomes of certain organisms, genes subsets selected, either from high-throughput experiments or with an established pivotal role regarding the probed disease, can act as a starting point for the exploration of their underlying functional interconnections. This may also aid the elucidation of hidden regulatory mechanisms among genes. Reverse engineering the functional relevance of genes to specific cellular pathways and vice versa, through the exploitation of the inner structure of the ontological vocabularies, may help impart insight regarding the identification and prioritization of the critical role of specific genes. The proposed graph-theoretical method is showcased in a pancreatic cancer and a T-cell acute lymphoblastic leukemia gene set, incorporating edge and Resnik semantic similarity metrics, and systematically evaluated regarding its performance.
Τίτλος πηγής δημοσίευσης:	Ieee Transactions on Biomedical Engineering
Τόμος/Κεφάλαιο:	58
Τεύχος:	12
Σελίδες:	3522-3527
Θεματική Κατηγορία:	[EL] Μηχανική (Γενικά). Πολιτική μηχανική (Γενικά)[EN] Engineering (General). Civil engineering (General)
Λέξεις-Κλειδιά:	Bioinformatics molecular network analysis ontological analysis semantic similarity systems biology Engineering, Biomedical
Αξιολόγηση από ομότιμους (peer reviewed):	Ναι
EU Grant identifier:	info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP7/231519
Κάτοχος πνευματικών δικαιωμάτων:	© IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC
Ηλεκτρονική διεύθυνση περιοδικού (link) :	http://ieeexplore.ieee.org/servlet/opac?punumber=10
Σημειώσεις:	Part 2
ΙΒΦΧΒ: αρχειακή συλλογή:	Ινστιτούτο Βιολογικών Ερευνών και Βιοτεχνολογίας (ΙΒΕΒ) (έως 2012)
Εμφανίζεται στις συλλογές:	Ινστιτούτο Χημικής Βιολογίας - Επιστημονικό έργο