Παρακαλώ χρησιμοποιήστε αυτό το αναγνωριστικό για να παραπέμψετε ή να δημιουργήσετε σύνδεσμο προς αυτό το τεκμήριο: https://hdl.handle.net/10442/12419
Export to:   BibTeX  | EndNote  | RIS
Εξειδίκευση τύπου : Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό
Τίτλος: X-ray sequence ambiguities of Sclerotium rolfsii lectin resolved by mass spectrometry
Δημιουργός/Συγγραφέας: Sathisha, G. J.
Prakash, Y. K. Subrahmanya
Chachadi, V. B.
Nagaraja, N. N.
Inamdar, S. R.
[EL] Λεωνίδας, Δημήτρης Δ.[EN] Leonidas, Demetres D.
Savithri, H. S.
Swamy, B. M.
Εκδότης: Springer Wien
Τόπος έκδοσης: NEW YORK
Ημερομηνία: 2008-08
Γλώσσα: Αγγλικά
ISBN: 0939-4451
DOI: 10.1007/s00726-007-0624-y
Περίληψη: X-ray crystallography, although a powerful technique for determining the three-dimensional structure of proteins, poses inherent problems in assigning the primary structure in residues Asp/Asn and Glu/Gln since these cannot be distinguished decisively in the electron density maps. In our recently published X-ray crystal structure of the Sclerotium rolfsii lectin (SRL) at 1.1 angstrom resolution, amino acid sequence was initially deduced from the electron density map and residues Asp/Asn and Glu/Gln were assigned by considering their hydrogen bonding potential within their structural neighborhood. Attempts to verify the sequence by Edman sequencing were not successful as the N terminus of the protein was blocked. Mass spectrometry was applied to verify and resolve the ambiguities in the SRL X-ray crystal structure deduced sequence. From the Matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight-mass spectrometry (MALDI TOF-MS) and liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry (LC-ESI-MS/MS) analysis of tryptic and chymotryptic peptides of SRL, we could confirm and correct the sequence at five locations with respect to Asp/Asn and Glu/Gln. Analysis data also confirmed the positions of Leu/Ile, Gln/Lys residues and the sequence covering 118 of the total 141 residues accounting to 83.68% of the earlier deduced sequence of SRL.
Τίτλος πηγής δημοσίευσης: Amino Acids
Τόμος/Κεφάλαιο: 35
Τεύχος: 2
Σελίδες: 309-320
Θεματική Κατηγορία: [EL] Βιοχημεία[EN] Biochemistry
Λέξεις-Κλειδιά: Sclerotium rolfsii lectin
amino acid sequence
mass spectrometry
protein crystal structure
Αξιολόγηση από ομότιμους (peer reviewed): Ναι
Κάτοχος πνευματικών δικαιωμάτων: © SPRINGER
Ηλεκτρονική διεύθυνση περιοδικού (link) : http://www.springer.at/amino_acids
ΙΒΦΧΒ: αρχειακή συλλογή: Ινστιτούτο Οργανικής και Φαρμακευτικής Χημείας (ΙΟΦΧ) (έως 2012)
Εμφανίζεται στις συλλογές:Ινστιτούτο Χημικής Βιολογίας - Επιστημονικό έργο

Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο:
Αρχείο ΣελίδεςΜέγεθοςΜορφότυποςΈκδοσηΆδεια 
12419.pdf
  Restricted Access
287.95 kBAdobe PDFΔημοσιευμένη/του ΕκδότηΔείτε/ανοίξτε