Εξειδίκευση τύπου :	Άρθρο σε επιστημονικό περιοδικό
Τίτλος:	Derivation of cancer related biomarkers from DNA methylation data from an epidemiological cohort
Δημιουργός/Συγγραφέας:	Valavanis I. Sifakis E.G. [EL] Γεωργιάδης, Παναγιώτης[EN] Georgiadis, Panagiotis [EL] Κυρτόπουλος, Σωτήριος Α.[EN] Kyrtopoulos, Soterios A. [EL] Χατζηιωάννου, Αριστοτέλης[EN] Chatziioannou, Aristotelis
Εκδότης:	Springer Verlag
Ημερομηνία:	2013
Γλώσσα:	Αγγλικά
ISSN:	1865-0929
DOI:	10.1007/978-3-642-41016-1_27
Περίληψη:	DNA methylation profiling methods exploit microarray technologies and provide a wealth of high-volume data. This data solicits generic, analytical pipelines for the meaningful systems-level analysis and interpretation. In the current study, an intelligent framework is applied, encompassing epidemiological.DNA methylation data produced from the Illumina's Infinium Human Methylation 450K Bead Chip platform, in an effort to correlate interesting methylation patterns with cancer predisposition and in particular breast cancer and B-cell lymphoma. Specifically, feature selection and classification are exploited in order to select the most reliable predictive cancer biomarkers, and assess their classification power for discriminating healthy versus cancer related classes. The selected features, which could represent predictive biomarkers for the two cancer types, attained high classification accuracies when imported to a series of classifiers. The results support the expediency of the methodology regarding its application in epidemiological studies.
Τίτλος πηγής δημοσίευσης:	Communications in Computer and Information Science
Τόμος/Κεφάλαιο:	384
Σελίδες:	249-256
Θεματική Κατηγορία:	[EL] Βιολογία (Γενικά)[EN] Biology (General) [EL] Τεχνολογία (Γενικά)[EN] Technology (General)
Λέξεις-Κλειδιά:	Cancer Classification DNA methylation profiling Epigenomic analysis Feature selection Microarrays
Αξιολόγηση από ομότιμους (peer reviewed):	Ναι
Κάτοχος πνευματικών δικαιωμάτων:	© Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2013.
Εμφανίζεται στις συλλογές:	Ινστιτούτο Χημικής Βιολογίας - Επιστημονικό έργο